Специалисты серологического отдела владеют всеми методами серологической диагностики(РА, РСК, РИД, РДСК, РНГА, РМА, РБП, ИФА(лейкоз), РАпл., ФР). Исследованию подвергается сыворотка крови, кровь, пат.материал, кож.сырье и моча от всех видов животных. Исследования производят на антропозоонозные заболевания (передающиеся от животных к человеку) такие как бруцеллез, листериоз, хламидиоз, лептоспироз, лейкоз, сап, сибирская язва, а так же случная болезнь лошадей, мулов, ослов, верблюдов, инфекционный эпидидимит. В составе серологического отдела находится ПЦР лаборатория. Специали ПЦР лаборатории владеют навыками ПЦР диагностики всех инфекционных заболеваний и ГМИ(растительного и животного происхождения: соя, кукуруза, картофель, рис, мясо разных видов животных) в продуктах питания.

  Материалом для исследования служат: кровь, сыворотка крови, соскоб эпителиальных клеток из урогенитального тракта, секрет предстательной железы, сперма, моча, фекалии, ликвор(спинномозговая жидкость), слезная жидкость, биопсийный и аутопсийный  материал, мазки с коньюктивы, мазки из полости носа, мазки из ротоглотки, смывы из полости носа, смывы из ротоглотки, мокрота, бронхо-альвиолярный лаваж или промывные воды бронхов, слюна, сырье и пищевые продукты для определения наличия генетически модифицированных ингредиентов, клещи, комары и эктопаразиты (вши и блохи). Для определения возможных очагов распостранения инфекции исследуются: почва, трава, фураж, подстилка, вода, стоки, смывы.